* Kegiatan Siswa-Santri :
Kegiatan-kegiatan untuk peningkatan ketaqwaan, kemampuan akademik, kemandirian, jiwa kepemiminan, serta watak kepribadian yang unggul. Kegiatan siswa dilaksanakan melalui kegiatan ekstra kurikuler yang meliputi :
- Bidang Seni : Tilawah, Khot, Hadroh
- Bidang Olahraga : Pencak silat, tenis meja
- Bidang Bahasa : Arab-English Club, Pidato 4 Bahasa (Arab, Ingris, Jawa dan Indonesia)
- Bidang Jurnalistik : Buletin Nurul Islam
- Bidang Agama : Kultum/Ceramah, TPA/TQA, dan Tahfidzul Qur'an
- Pramuka, Prodiklat Ramadhan, dan Pengabdian Masyarakat.
* Kegiatan Pesantren :
Selain kegiatan sekolah, di SMP Islam Yogyakarta, dan atau SMA Sultan Agung Yogyakarta, juga diberikan materi-materi kepesantrenan yang dapat menunjang dan mendukung pelajaran di sekolah yaitu :
- Pengajian Sorogan (individu),
- Pengajian Bandongan
- Tahfidzul Qur'an
- Madrasah Diniyah
- Kewirausahaan
- Dll.
* Ekstrakurikuler :
| Nama Kegiatan | Pembimbing | Waktu |
| Drum Band | ||
| Hadrah/Rebana | ||
| English - Arab Club | ||
| Pramuka | ||
| Komputer | ||
| BTA (Baca Tulis Al-Qur’an), dan Tahfidzul Qur'an | ||
| Kitobah / Pidato 4 Bahasa (Indonesia, Jawa, Inggris, dan Arab) | ||
| Pencak Silat | ||
| Tenis Meja | ||
| Bulutangkis | ||
| Futsal |
Penguasaan IPTEK :
